Ну и хрень вам тут понаписали, половина постов вообще не в тему.
По поводу тематичности, она влияет конечно, но это не ключевой показаетль, траст доноров гораздо выше роль играет. Кроме того тематичность играет роль для сайтов акцепторов и доноров, которым эта категория присуждена, то есть они находятся в ЯК. Для всех остальных идет категория интернет. Так что сайты которые не в ЯК по сути в одной категории находятся.
По поводу проставления таких же ссылок что и на другой сайт, тиц будет, но скорее всего 10, если вообще будет, так как ссылки будут с техже страниц, а следовательно вес уменьшится. Можете проставить ссылки, но в таком случае увеличивайте ссылочную массу, как на первый, так и на второй сайт.
И по поводу хелпов и справок яндекса, там много чего написано, например что ссылки с форумов, каталогов и прочей немодерируемой хрени не учитывается,да вот только практика показывает совершенно обратное, птиц растет как на дрожжах, правда есть шанс схватить бан по другим факторам, но если все делать правильно непосредственно на самом сайте, то все будет хорошо,но это уже совсем другая история.

Я про скрипт сбора ссылок под гугл по вашим запросам для поднятия ПР

Да в принципе не критично, так как есть у меня другие решения сбора беков с яху, с большим интересом жду от вас скриптов для работы с гуглом.

Купил методу, скрипты свое дело делают, только яху у меня что то работать отказался

Notice: Undefined offset: 1 in C:\wamp\www\yahoo\parser.php on line 62

Вот такую ошибку выдает

По идее нет, но я сталкивался с почти подобным, только неомню сейчас что за хостинг был.
Там ни через ФТП ни через шел нельзя было увидеть файл .htacces
А в вашем случае надо было попробовать через шел доступ посмотреть. К примеру при помощи PUTTY или аналогичной программы