если снимите ссылки (а их было много) или поменяете их, то яндекс может и полгода думать. я так делал на одном сайте, менял релевантность... земенял старые ссылки на новые на другую... так старая страница до сих пор в выдаче, а прошло уже несколько месяцев... много ссылок в старом кэше сохранилось. хотя у меня эти запросы не в топе были
если ваши запросы в топе, то не вижу смысла менять релевантность страниц, тем более посетитель попав на главную уже должен иметь представление о деятельности сайта и быстро найти искомое.

Тогда не нужно дергаться. Если уж очень хочется, меняйте релевантность самих страниц (главной и той что больше подходит под запрос). Пока будете это делать, следите за позицией главной страницы в выдаче, если еще вырастет, ничего больше не делайте. Это может произойти, если у вас было перенасыщение главной страницы и она станет более релевантной, хотя вы оттуда уберете все прямые вхождения, например. Бывает и такое. Но если у конкурентов прямых вхождений у каждого штук по 12, тогда вряд ли вы там останетесь.

Замечание модератора: Эта тема была закрыта автоматически ввиду отсутствия активности в ней на протяжении 100+ дней. Если Вы считаете ее актуальной и хотите оставить сообщение, то воспользуйтесь кнопкой или обратитесь к любому из модераторов.