На форуме уже были созданы темы о нехватке/покупке лимитов для Яндекс.XML. На данный момент в программе Site-Reporter, за счет прямого парсинга выдачи яндекс, можно обойтись без xml. Так как это сделано программно и есть возможность снимать позиции во всех регионах, то это является прекрасной альтернативой.
Подробнее, как настроить программу на прямой парсинг и как ей пользоватся, вы сможете ознакомится в статье.
К комментариям прошу задавать любые вопросы как о ситуации с XML яндекс, так и о работе программы.