1. Создаем поддомен
2. Переносим сайт на новый поддомен
3. Добавляем новый сайт в панели вебмастера Яндекс и Google и подтверждаем права
4. Создаем xml карту для нового сайта и копируем её в корень сайта
5. Добавляем созданные xml карты для нового и старого сайтов в панели вебмастера Яндекс и Google
6. Добавляем директивы Host: site.domain.com и Sitemap: http://site.com.ua/sitemap.xml в robots.txt на старом сайте
7. Добавляем директивы Host: site.domain.com и Sitemap: http://site.domain.com/sitemap.xml в robots.txt на новом сайте
8. Редактируем .htaccess на старом сайте следующим образом:
Код:
<FilesMatch "robots.txt$">
RewriteEngine off
</FilesMatch>

<FilesMatch "sitemap.xml$">
RewriteEngine off
</FilesMatch>

RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{HTTP_HOST} site.com.ua$ [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://site.domain.com/$1 [L,R=301]

Такая настройка .htaccess даёт прозрачный редирект со старого сайта на новый
однако позволяет роботам Яндекса считывать файл robots.txt и sitemap.xml, в следствии чего роботы Яндекса видят главное зеркало Host: newsite.ru и правильно перенаправляет все страницы старого сайта на новый по xml карте.