Цель какая, склеить? Тогда редиректом 301.

Или просто запретить для ботов? Это через `robots.txt`, если есть возможность распознавать хост через php и отдавать разные robots.

Или просто чтобы выдавало HTTP404? Тогда NS поменяйте на какие-нибудь чужие, где нет привязки к этому домену. Или просто удалите алиас у себя на хостинге.

rjksdfhe,
Надо запретить для ботов индексировать один из доменов, только вот как прописать? Так как они тянут все с одной папки.

Можно путем правки кода CMS прописать проверку и для неиндексируемого сайта либо отправлять заголовок сервера Noindex либо мета-тег noindex - это, наверное, проще сделать, чем роботс разный раздавать и намного надежнее т.к. роботс это рекомендация, а ноиндекс практически директива и даже если страница уже попала в ПС, то с ноиндекс она оттуда будет исключена

umbertone, если сделать Noindex, так это поможет нам для одной ПС, а как сделать для двух сразу? Или может я что не правильно понял?

amit, под noindex имеется в виду <meta name="robots" content="noindex"/> - его просто надо добавить к мета-тэгам сайта, который не хотите индексировать. этот тег понимают и яндекс и гугл.

кстати, есть ещё одно решение и одно намного лучше если задача стоит убрать дубликаты контента:
нужно прописать мета-тег rel=canonical для второстепенного сайта и указать в качестве канонической версию страницы на основном сайте.

это прийдется на каждую страницу ставить?

Верно.
А лучше склейте домены.
Позже, возможно, и продадите))

amit, да, решается опять таки очень просто правкой шаблона цмс, особенно если сайты полностью идентичны

да это клиентский и у них за...б что бы оба два работали(