Ожидание ответа сервера при запросе xxxxxx.ru занимает от 1.5 до 4 сек, в момент запроса процесс php создаёт ощутимую нагрузку на CPU. В процессе работы скриптов сайта происходит обращение к 196 файлам, что может являться причиной медленной обработки запросов. Кроме этого проблем в работе VPS не наблюдается.
Рекомендуем обратиться к разработчикам Вашего сайта для оптимизации работы скриптов сайта.