Ничего не будет если на втором сайте продвигаются отличные темы от первого сайта. Пересечений не будет. Аффилиат присваивается если от 1 владельца идет несколько сайтов с одинаковым содержанием по документу. В таком случае выдается наиболее релевантный ТОЛЬКО 1 документ с двух сайтов. Для лучшего продвижения можно заточить каждый сайт под свою узкую тему и это как то указать в шапке сайта.

Сайт должен быть уникальным и по контенту и по дизайну

Я бы не рисковал испольховать одинаковый шаблон для 2-х сайтов схожей тематики да еще и на одном хостинге расположенных. Лучше изначально перестраховаться и уникализировать шаблоны, чем потом арзбираться, почему сайт не растет. Уникализиация шаблона стоит всего пару тысяч рублей. Можно все очень быстро отбить, если сайт хороший и прибыльный.

Я так понимаю тематика хоть и игровая, но жанры разные например? Сделайте просто более менее разные дизайны ну и конечно все сео работы. Потому как снять фильтр аффилиат практически нелзя, как сео хаус говорит. Придется кардинально тематику меенять.

Присоединяюсь к мнению, что если сам контент разный, то никакого влияния одинаковый дизайн/шаблон не окажет.

Прошло уже 4 месяца, а ТСу все советы дают
За такой промежуток времени он уже сам выводы сделал.

balsanis, так ведь здесь и молодежь пасется, трошки обучается...
я, собственно о том, что шаблон - набор спец-символов, грубо говоря, которые ПС учитывают, сравнивают и делают выводы...

Тогда будет полезно, если ТС зайдет, и сам отпишет, к каким выводам пришел.

Не влияет. Иначе добрая часть сайтов на CMS с одинаковыми шаблонами были бы пессимизированы.

уникальность сайта по всем показателям превыше всего!