Наткнулся на одну статью, которая ссылается на полуторагодичные исследования компании AV-Test.
Эта компания с августа 2011 по февраль 2013 года мониторила выдачу Google, Яндекса, Bing и ещё одной непопулярной на Руси ПС (Blekko). Каким именно образом проходил процесс проверки компания не сообщает, но в итоге имеем вот что:
1. Blekko - проверенно 3 с лишним ляма сайтов из выдачи. Из них 203 вредоносные (реально вредоносные, а не подозрительные)
2. Google - проверено 10,9 лямов сайтов из выдачи. Из них всего 272 вредоносные
3. Bing - проверено тоже около 10,9 млн, из которых 1285 сайтов оказались вредоносными.
4. Яндекс - проверено почти 13,7 млн сайтов. Из них аж 3330 опасных сайтов
собственно, кому интересно вот архив с отчётом из первоисточника.
Для наглядности немного инфографики:


Могучие специалисты AV-Test констатировали активный рост вредоносных ресурсов которые юзают в основном всяческие уязвимости в устаревших версиях браузеров, PDF-ридеров и другого ПО, т.е. лучшей защитой будет регулярное обновление вашего софта до актуальных версий. Кстати вчера Wild вполне красочно рассказал о необходимости постоянно обновлять ПО.
Забавный факт, в середине 2010 компания Barracuda Labs проводила исследование, согласно которому google содержал больше опасных сайтов (ну в смысле содержал в выдаче) чем яху, бинг и твиттер вместе взятые.

На всё это Яндекс ответил шквалом встречных вопросов: почему не объяснили методику определения вредоносного сайта, почему разнится количество проверенных сайтов для каждой ПС. Так же Яндекс заметил, что другие ПС заражённые сайты тупо удаляют из выдачи, а Яндекс просто помечает его и предупреждает юзеров. Т.е. результат тестов получился не совсем объективным, ведь вполне вероятно, что Яндекс пометил абсолютно все вредоносные сайты, а значит он бэст-оф-зе-бэст! Ну и напоследок представители Яндекса заявили, что технологии обнаружения заражённых сайтов меняются намного чаще чем раз в 18 месяцев (именно столько проводился тест) и это нужно обязательно учесть.
В итоге было обещано дать исчерпывающий, развёрнутый ответ, после того, как AV-Test ответит на все вопросы Яндекса и расскажет о таинственной методике поиска.
Вот такие пироги