Iga, Лучше использовать поддомен, где название поддомена соответствующий город/район/улица.
Также желательно указывать местный адрес и если поддомены по всей России - то телефон 8-800
Потом для каждого поддомена города настроить Яндекс.Вебмастер и присвоить соответствующий регион.
Также желательно сделать перелинковку между доменами и на каждый домен поставить по 1-2 ссылке (можно купить 3-4 сквозных ссылки, урлы которых будут ссылаться на поддомены)