Похоже, что всё-таки сайт именно занесён в черные списки антивирусов по вине предыдущего владельца, там более, что домен был куплен меньше чем через месяц после освобождения.

Выход один - писать в поддержку антивирусов и сообщать о ложном срабатывании. Например, для kis сюда, avast, dr.web и т.д. А со временем и другие менее известные антивирусы уберут сайт из базы.