Начнем от общего к частному, факторы делятся на внешние и внутренние.
К внутренним факторам я отношу:
Техническое состояние cайта:


* Отсутствие дублей страниц

* корректная работа 404 страницы

* корректный ответ сервера у всех страниц

* правильная работа редиректов

* наличие карты сайта


Правильный и грамотно структурированный текст:


* Текст должен отвечать на те запросы, под который он оптимизирован и выдавать полный ответ на запрос.

* Текст нужно структурировать по смысловым блокам таким образом, чтобы посетитель сайта мог найти интересующий абзац не читая весь текст

* Использование спецтерминов в тексте, свойственных тематике
* Общее количество уникальных слов на сайте

>>Пример структуры страниц для сайта медицинской тематики<<

Грамотно подобранный контент:


* Фото контент

* Видео контент

* Инфографика

* Различные элементы функционала: кнопки, формы заказа, калькуляторы, информеры и так далее, в зависимости от тематики


Регулярно обновляемый контент:
Для каждого сайта я стараюсь внедрить раздел, куда удобно будет добавлять постоянно обновляемый контент, например новости, блог и так далее.
Это помогает загнать на сайт быстро робота, что в свою очередь улучшает скорость индексации сайта, а так же помогает повысить траст сайта и при правильной перелинковке накачать посадочные страницы, ну и дополнительный трафик.

Поведенческие факторы:


* Кликабельный сниппет

* % возвращения на сайт

* % прямых заходов на сайт от общего числа

* переходы с других сайтов

* вовлеченность пользователя (время на сайте, кол-во просмотренных страниц)

* удовлетворенность полнотой ответа (имеется ввиду, что пользователь заканчивает поиск после посещения сайта)


Перелинковка:
Грамотно организованная перелинковка, тут все просто, нужно организовать перелинковку так, чтобы согнать вес(пощупать вес можна Линкоскопом и page weight) на продвигаемые страниц.

Наличие сервисов от поисковых систем


* вебмастер

* счетчик

* новости

* поиск и др.


К внешним факторам я отношу:

Ссылочный фактор:


* Нужно соблюдать естественный % анкорных к безанкорным и ссылок с картинок
* Наличие ссылок со всех источников: форумы, блоги, тематические сайты, нетематические сайты, каталоги и др.

* естественный % nofollow ссылок

* наличие ссылок из комментариев


Социальные факторы:



* наличие социальных сообществ

* наличие кнопок мне нравится и поделиться а так же виджета группы на сайте

* траффик из социальных сетей

* количество упоминаний в социальных сетях



Я так понимаю Яндекс пытается снизить влияние факторов, которые можно измерить и манипулировать, вижу что внутренние факторы, контент и функционал стал оказывать все большее влияние на ранжирования, так же заметна тенденция на социализацию, но сейчас влияние социальных факторов сейчас не сильно заметно. Ну и кончено основное влияние оказывают поведенческие факторы.
Ссылки не отменили, а просто строже стали к ним относиться, я так понимаю яндекс просто ввел дополнительные усложненные метрики для измерения качества ссылок.