add_filter('comment_form_fields', 'reorder_comment_fields' );
function reorder_comment_fields($fields){

$new_fields = array(); // поля в новом порядке

$myorder = ['author',
'email',
'url',
'comment',
'cancel_reply_before',
'cancel_reply_link',
'cancel_reply_after',
'submit_button',
'submit_field']; // нужный порядок

foreach($myorder as $key){
$new_fields[$key] = $fields[ $key ];
unset( $fields[$key] );
}

// если остались еще какие-то поля добавим их в конец
if( $fields )
foreach( $fields as $key => $val )
$new_fields[ $key ] = $val;

return $new_fields;
}